36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3734 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  38.12 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  41.41 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  33.64 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  37.23 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  35.54 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  33.1 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  35.58 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  32.85 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  35.71 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  39.36 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  31.45 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  35.58 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  34.15 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  32.08 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  32.08 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  29.08 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  39.73 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  31.76 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  26.32 
 
 		 271 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  30 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  26.09 
 
 		 269 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  40.38 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  32.46 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  26.5 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  40.74 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  24.18 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1636  Ion transport 2 domain protein  48.94 
 
 		 366 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  26.13 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  26.13 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  26.13 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  31.13 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  27.03 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0457  Ion transport 2 domain-containing protein  51.06 
 
 		 133 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0447878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>