38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3299 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3299  putative urease accessory protein  100 
 
 		 251 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0670119  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  46.34 
 
 		 231 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  44.98 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  47.81 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  32.93 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  30.24 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  34.43 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  31.56 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  26.53 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  44.09 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  23.95 
 
 		 196 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  24.69 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  25.82 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  27.38 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  29.9 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0110  high-affinity nickel-transporter  36.64 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  24.17 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  23.7 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  25 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  26.22 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  26.67 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2147  high-affinity nickel-transporter  27.61 
 
 		 343 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.568243  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2553  high-affinity nickel-transporter  30 
 
 		 336 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3174  high-affinity nickel-transporter  31.72 
 
 		 339 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93398  predicted protein  30.46 
 
 		 329 aa  45.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5861  high-affinity nickel-transporter  30.83 
 
 		 347 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132218  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13431  hypothetical protein  26.81 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1917  high-affinity nickel-transporter  30 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2529  high-affinity nickel-transporter  30 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0441819  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2447  high-affinity nickel-transporter  30.36 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000455077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0559  high-affinity nickel-transporter  33.33 
 
 		 339 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397996  hitchhiker  0.000504987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0795  high-affinity nickel-transporter  38.67 
 
 		 352 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2577  high-affinity nickel-transporter  29.46 
 
 		 347 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1988  high-affinity nickel-transporter  39.39 
 
 		 364 aa  42.4  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1396  high-affinity nickel-transporter  46.51 
 
 		 340 aa  42  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0483986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0731  high-affinity nickel-transporter  37.33 
 
 		 362 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2422  high-affinity nickel-transporter  30.63 
 
 		 343 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.178325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0791  high-affinity nickel-transporter, (NiCoT) family  31.72 
 
 		 338 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>