63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2016 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2016  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.375454  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0907  protein of unknown function DUF455  53.85 
 
 		 268 aa  83.6  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0992  hypothetical protein  53.85 
 
 		 268 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1165  hypothetical protein  48.51 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2102  hypothetical protein  52.69 
 
 		 286 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5975  hypothetical protein  52.69 
 
 		 286 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2120  hypothetical protein  52.69 
 
 		 286 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1073  protein of unknown function DUF455  43.14 
 
 		 294 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1172  hypothetical protein  52.17 
 
 		 285 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837693 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1434  hypothetical protein  48.91 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0898  hypothetical protein  44.44 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.549388  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1042  hypothetical protein  44.44 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.839264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2572  hypothetical protein  49.44 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1899  hypothetical protein  49.44 
 
 		 319 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1461  hypothetical protein  49.44 
 
 		 272 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2626  hypothetical protein  49.44 
 
 		 272 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2188  hypothetical protein  49.44 
 
 		 272 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3130  hypothetical protein  49.44 
 
 		 336 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2706  hypothetical protein  49.44 
 
 		 336 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1685  hypothetical protein  49.44 
 
 		 283 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0445395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5113  hypothetical protein  50.55 
 
 		 268 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565314 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1421  hypothetical protein  47.31 
 
 		 265 aa  67  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1134  hypothetical protein  45.74 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3189  hypothetical protein  45.05 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2139  hypothetical protein  50.54 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1317  hypothetical protein  52.75 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2012  hypothetical protein  49.43 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0977  protein of unknown function DUF455  45.16 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.534107  normal  0.0470434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5408  hypothetical protein  51.85 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1578  hypothetical protein  66.67 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.769891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1305  hypothetical protein  42.22 
 
 		 271 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.823956  normal  0.719923 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0531  protein of unknown function DUF455  50.79 
 
 		 265 aa  60.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1177  hypothetical protein  44.32 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2555  protein of unknown function DUF455  62.5 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00755068  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3453  protein of unknown function DUF455  47.46 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0923  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1096  hypothetical protein  51.65 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1152  hypothetical protein  46.67 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0813  protein of unknown function DUF455  40 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1476  hypothetical protein  40.66 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1443  hypothetical protein  44.94 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0403577  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0583  hypothetical protein  48 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02503  hypothetical protein  41.98 
 
 		 278 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2112  hypothetical protein  38.3 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1911  protein of unknown function DUF455  60.98 
 
 		 275 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0883  hypothetical protein  42.37 
 
 		 255 aa  53.9  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1923  protein of unknown function DUF455  40.23 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2118  protein of unknown function DUF455  41.76 
 
 		 275 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  decreased coverage  0.00309325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1119  hypothetical protein  59.57 
 
 		 264 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0467888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2263  hypothetical protein  37.93 
 
 		 275 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0932  protein of unknown function DUF455  43.82 
 
 		 276 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2528  hypothetical protein  39.74 
 
 		 275 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  0.122496 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1090  hypothetical protein  57.14 
 
 		 280 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1177  protein of unknown function DUF455  56.1 
 
 		 285 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0199294  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1060  hypothetical protein  42.86 
 
 		 283 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0122  hypothetical protein  53.49 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0122  hypothetical protein  53.49 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3271  hypothetical protein  41.38 
 
 		 271 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1883  hypothetical protein  47.5 
 
 		 260 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1053  hypothetical protein  47.62 
 
 		 274 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108058  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2183  hypothetical protein  53.49 
 
 		 263 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3914  hypothetical protein  53.19 
 
 		 281 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2484  hypothetical protein  46.15 
 
 		 278 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>