20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1643 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1643  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  303  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139577 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4515  hypothetical protein  47.65 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0421  hypothetical protein  41.13 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1173  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5391  hypothetical protein  42.72 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0026  hypothetical protein  45.16 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0028  hypothetical protein  45.16 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.897017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0027  hypothetical protein  45.16 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  hitchhiker  0.000412505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1464  hypothetical protein  48.28 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1252  hypothetical protein  46.88 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0147  hypothetical protein  42.42 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2715  hypothetical protein  40.83 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000424232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4537  hypothetical protein  47.67 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2195  hypothetical protein  56.45 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0043  hypothetical protein  38.65 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4365  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4498  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225753  normal  0.0328772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2266  twin-arginine translocation pathway signal  32.26 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0477922  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6192  hypothetical protein  35.85 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1229  hypothetical protein  29.91 
 
 		 161 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>