23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1567 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  294  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  87.77 
 
 		 138 aa  256  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  82.01 
 
 		 141 aa  246  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  80.58 
 
 		 140 aa  241  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  76.26 
 
 		 144 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  76.26 
 
 		 144 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  76.26 
 
 		 144 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  75.54 
 
 		 144 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  74.82 
 
 		 144 aa  227  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.5 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  70.5 
 
 		 144 aa  218  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  74.1 
 
 		 141 aa  218  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  70.99 
 
 		 141 aa  214  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  64.96 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  66.42 
 
 		 151 aa  188  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  42.62 
 
 		 191 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  42.74 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.99 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  41.23 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  34.78 
 
 		 266 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.67 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>