26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0753 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0753  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.0231659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1452  hypothetical protein  53.45 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.965141  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4516  hypothetical protein  51.67 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3822  hypothetical protein  38.6 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4691  hypothetical protein  48 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3672  hypothetical protein  48 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3194  hypothetical protein  47.17 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2853  hypothetical protein  47.17 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0511  hypothetical protein  47.17 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0493  hypothetical protein  47.17 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1426  hypothetical protein  47.17 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0166  hypothetical protein  47.17 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4388  hypothetical protein  44.68 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0923  hypothetical protein  49.15 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0676  hypothetical protein  47.17 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0429  hypothetical protein  45.28 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1678  putative transmembrane protein  46.43 
 
 
70 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2843  hypothetical protein  42.59 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238867  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2229  hypothetical protein  42.59 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2854  hypothetical protein  42.59 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0264  hypothetical protein  40.43 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6173  hypothetical protein  48.78 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0241  hypothetical protein  45.45 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0131422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2760  hypothetical protein  48.78 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198778  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2899  hypothetical protein  48.78 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869288  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0317  transmembrane protein  39.22 
 
 
74 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>