17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1905 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1905  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  660    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  43.09 
 
 		 1931 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  43.16 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  40.86 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3773  hypothetical protein  35.79 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0715  hypothetical protein  39.8 
 
 		 149 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.100612  normal  0.0883598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.49 
 
 		 420 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0606  competence-like protein  41.67 
 
 		 140 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.216559  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2088  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.88 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7022  hypothetical protein  32.67 
 
 		 158 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4471  hypothetical protein  29.46 
 
 		 155 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2261  hypothetical protein  35.63 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000590527  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 477 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02760  hypothetical protein  31.25 
 
 		 164 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1903  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 451 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.140876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 		 406 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>