12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8509 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8509    100 
 
 		 1405 bp  2785    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.577917  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  87.3 
 
 		 2967 bp  61.9  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  87.3 
 
 		 2895 bp  61.9  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  87.3 
 
 		 2967 bp  61.9  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  87.3 
 
 		 2967 bp  61.9  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  85.71 
 
 		 2967 bp  54  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  85.71 
 
 		 2967 bp  54  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  85.71 
 
 		 2967 bp  54  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  85.71 
 
 		 2967 bp  54  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1575    85.71 
 
 		 1881 bp  54  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  86.21 
 
 		 3048 bp  52  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  93.75 
 
 		 2967 bp  48.1  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>