39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7987 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7987    100 
 
 		 927 bp  1838    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  82.62 
 
 		 966 bp  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  83.01 
 
 		 843 bp  232  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  85.12 
 
 		 834 bp  97.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  84.17 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  84.17 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  84.17 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  84.17 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  84.17 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  84.17 
 
 		 951 bp  87.7  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1952    91.67 
 
 		 2579 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  83.17 
 
 		 960 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  83.87 
 
 		 966 bp  65.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  83.17 
 
 		 960 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  83.17 
 
 		 513 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  83.17 
 
 		 960 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  83.17 
 
 		 960 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  85.19 
 
 		 798 bp  65.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  80.99 
 
 		 558 bp  58  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 984 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 990 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 861 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    87.5 
 
 		 980 bp  56  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 990 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  87.5 
 
 		 387 bp  56  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 462 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 990 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  80.3 
 
 		 951 bp  56  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  87.76 
 
 		 621 bp  50.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  81.72 
 
 		 780 bp  50.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2536    96.55 
 
 		 950 bp  50.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0525    81.72 
 
 		 789 bp  50.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>