37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7233 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7233  protein of unknown function DUF1508  100 
 
 		 61 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6482  hypothetical protein  85.25 
 
 		 61 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.068016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2795  protein of unknown function DUF1508  73.77 
 
 		 61 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0497827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2504  protein of unknown function DUF1508  73.77 
 
 		 61 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2572  hypothetical protein  73.77 
 
 		 61 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259353  normal  0.786456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3815  hypothetical protein  75.41 
 
 		 61 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0972  hypothetical protein  54.55 
 
 		 56 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.859574  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  50.88 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  50.88 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  57.78 
 
 		 523 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  54.39 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  47.37 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1927  hypothetical protein  43.75 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062835  decreased coverage  0.000000000000486624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0066  hypothetical protein  47.17 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  56.82 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  52.27 
 
 		 557 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  48.21 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2059  hypothetical protein  46.43 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  41.51 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0562  protein of unknown function DUF1508  56.76 
 
 		 211 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5390  protein of unknown function DUF1508  38.46 
 
 		 226 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1378  hypothetical protein  40.62 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  41.67 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2960  protein of unknown function DUF1508  46.81 
 
 		 298 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  44.44 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  44.44 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  39.62 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  48.89 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  36.84 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  36.84 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  33.33 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2449  protein of unknown function DUF1508  41.07 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0826  hypothetical protein  41.07 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  35.09 
 
 		 62 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0963  hypothetical protein  40 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0640567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  41.51 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3003  protein of unknown function DUF1508  36.73 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal  0.537023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>