33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3556 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3556  phage uncharacterized protein  100 
 
 
490 aa  999    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6997  phage uncharacterized protein  77.9 
 
 
491 aa  749    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6558  phage uncharacterized protein  59.63 
 
 
494 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5956  phage uncharacterized protein  60.75 
 
 
456 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  76.8 
 
 
492 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3004  Phage uncharacterized protein-like  42.43 
 
 
484 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2507  phage uncharacterized protein  37.33 
 
 
461 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0801  Phage uncharacterized protein-like  32.37 
 
 
466 aa  206  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814229  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2432  phage uncharacterized protein  50 
 
 
462 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.694395  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0377  Phage uncharacterized protein, C-terminal  28.48 
 
 
469 aa  186  7e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0430074  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1016  phage uncharacterized protein  29.91 
 
 
487 aa  182  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0660227  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0665  phage uncharacterized protein  27.55 
 
 
469 aa  179  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.410967  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0967  phage uncharacterized protein  25.21 
 
 
465 aa  172  7.999999999999999e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.451476  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1184  Phage uncharacterized protein-like  30.82 
 
 
493 aa  170  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0804  phage uncharacterized protein  31.04 
 
 
485 aa  163  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0814  phage uncharacterized protein  28.25 
 
 
451 aa  157  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.93566  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1048  phage uncharacterized protein  27.54 
 
 
516 aa  124  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0343018  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0224  phage uncharacterized protein  27 
 
 
488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1307  hypothetical protein  27.35 
 
 
505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0302  chaperone and heat shock protein 70  26.3 
 
 
484 aa  113  9e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.763978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2225  phage uncharacterized protein  26.51 
 
 
547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0340068  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2388  Phage uncharacterized protein, C-terminal  24.85 
 
 
516 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1212  phage uncharacterized protein  26.08 
 
 
461 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2266  phage uncharacterized protein  24.69 
 
 
512 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  hitchhiker  0.000265113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0376  hypothetical protein  56.67 
 
 
270 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00823  phage uncharacterized protein  25 
 
 
913 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2841  phage uncharacterized protein  25.37 
 
 
522 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1132  phage uncharacterized protein  25.89 
 
 
295 aa  91.3  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0542  phage uncharacterized protein  26.18 
 
 
495 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0014  hypothetical protein  23.26 
 
 
484 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3888  hypothetical protein  25.97 
 
 
496 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0957  hypothetical protein  25.99 
 
 
469 aa  57.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000035245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2305  phage uncharacterized protein, putative  22.94 
 
 
491 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>