18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0831 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0831    100 
 
 
258 bp  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280807  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8497    94.05 
 
 
555 bp  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6341    91.27 
 
 
367 bp  325  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  85.49 
 
 
1254 bp  212  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0162    86.21 
 
 
557 bp  155  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  87.95 
 
 
1206 bp  85.7  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09510    87.95 
 
 
1188 bp  85.7  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2712    84.96 
 
 
239 bp  81.8  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0279    86.3 
 
 
1215 bp  65.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  90.91 
 
 
1251 bp  56  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  90.91 
 
 
1251 bp  56  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  90.91 
 
 
1251 bp  56  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1737    90.91 
 
 
2420 bp  56  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460985  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  90.91 
 
 
1251 bp  56  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    90.91 
 
 
2455 bp  56  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  90.91 
 
 
1251 bp  56  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  87.04 
 
 
1209 bp  52  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 
945 bp  46.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>