16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0715 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0715  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1120  hypothetical protein  84.55 
 
 		 373 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4665  hypothetical protein  50.82 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0708  hypothetical protein  44.14 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0697  hypothetical protein  43.87 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0670  hypothetical protein  43.13 
 
 		 331 aa  203  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3048  hypothetical protein  30.84 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.442334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4637  hypothetical protein  32.99 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.0353411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2066  hypothetical protein  36.36 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  32.56 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1139  hypothetical protein  35.8 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.888592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1399  hypothetical protein  34.52 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.647959  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  26.58 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1947  hypothetical protein  34.15 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.757191  normal  0.0957628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0135  hypothetical protein  32.34 
 
 		 355 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79088  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  0.0393077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>