17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4139 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4139  nuclear transport factor 2  100 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4214  nuclear transport factor 2  100 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4370  nuclear transport factor 2  99.16 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0442394  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2053  nuclear transport factor 2  77.87 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4664  nuclear transport factor 2  78.69 
 
 		 123 aa  194  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3954  nuclear transport factor 2  46.49 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  46.55 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4817  steroid delta-isomerase  37.61 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2174  nuclear transport factor 2  33.91 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3765  nuclear transport factor 2  36.67 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581539  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  36.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3596  nuclear transport factor 2  32.48 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  32.52 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  39 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  31.48 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3259  protein of unknown function DUF1486  26.5 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0164408  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03745  FOG: Transposon-encoded proteins with TYA, reverse transcriptase,integrase domains in various combinations (ISS)  28.3 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>