29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3064 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3064  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  258  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3123  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  258  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3080  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  246  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3614  hypothetical protein  70.87 
 
 
127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0128407  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11614  hypothetical protein  52.42 
 
 
136 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.348324  normal  0.226893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2803  hypothetical protein  51.67 
 
 
122 aa  135  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0859  hypothetical protein  32.71 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.0660104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4210  hypothetical protein  35.05 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1850  hypothetical protein  37.89 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4276  hypothetical protein  35.05 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10534  hypothetical protein  34.74 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4437  hypothetical protein  35.05 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4219  hypothetical protein  32.26 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0917932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4285  hypothetical protein  32.26 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1500  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.978644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4446  hypothetical protein  31.18 
 
 
131 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.925382  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0930  hypothetical protein  34.69 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0415154  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1991  hypothetical protein  33.75 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1116  hypothetical protein  37.96 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3931  hypothetical protein  33.93 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440778  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3299  hypothetical protein  35.51 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  hitchhiker  0.00512982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1105  hypothetical protein  37.04 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.656035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1088  hypothetical protein  37.04 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1326  hypothetical protein  46.55 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5239  hypothetical protein  42 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80117  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1405  hypothetical protein  37.8 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.909436  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3134  hypothetical protein  40.32 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0765  hypothetical protein  39.71 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2495  hypothetical protein  43.55 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>