31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3931 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3931  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  251  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440778  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3299  hypothetical protein  76.61 
 
 
140 aa  190  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  hitchhiker  0.00512982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4219  hypothetical protein  47 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0917932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4285  hypothetical protein  47 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4446  hypothetical protein  45 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.925382  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4210  hypothetical protein  45 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4437  hypothetical protein  45 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4276  hypothetical protein  45 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1500  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.978644  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10534  hypothetical protein  38.46 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1991  hypothetical protein  42.86 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0859  hypothetical protein  38 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.0660104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0930  hypothetical protein  34.65 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0415154  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1326  hypothetical protein  40.51 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1116  hypothetical protein  35.48 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3064  hypothetical protein  33.93 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3123  hypothetical protein  33.93 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3080  hypothetical protein  33.93 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1105  hypothetical protein  34.41 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.656035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1088  hypothetical protein  34.41 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3614  hypothetical protein  33.98 
 
 
127 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0128407  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1405  hypothetical protein  31.03 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.909436  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1850  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0980  hypothetical protein  26.98 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11614  hypothetical protein  37.84 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.348324  normal  0.226893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2803  hypothetical protein  28.57 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1563  hypothetical protein  33.8 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1617  hypothetical protein  33.8 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1593  hypothetical protein  33.8 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  33.78 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4462  hypothetical protein  38.18 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.128486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>