28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1088 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1088  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  288  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1105  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  288  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.656035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1116  hypothetical protein  98.59 
 
 
142 aa  280  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1405  hypothetical protein  68.03 
 
 
143 aa  150  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.909436  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1500  hypothetical protein  39.52 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.978644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0859  hypothetical protein  43.59 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.0660104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10534  hypothetical protein  40.16 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4276  hypothetical protein  36.61 
 
 
131 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4437  hypothetical protein  36.61 
 
 
131 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4210  hypothetical protein  36.61 
 
 
131 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1991  hypothetical protein  33.07 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1326  hypothetical protein  46.97 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4219  hypothetical protein  33.03 
 
 
131 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0917932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4285  hypothetical protein  33.03 
 
 
131 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4446  hypothetical protein  33.04 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.925382  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1850  hypothetical protein  39.56 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0930  hypothetical protein  34.43 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0415154  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3299  hypothetical protein  36.36 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  hitchhiker  0.00512982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3064  hypothetical protein  37.04 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3123  hypothetical protein  37.04 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3080  hypothetical protein  37.04 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2803  hypothetical protein  34.58 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3931  hypothetical protein  34.41 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440778  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3614  hypothetical protein  31.15 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0128407  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11614  hypothetical protein  30.91 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.348324  normal  0.226893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1563  hypothetical protein  28.21 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1617  hypothetical protein  28.21 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1593  hypothetical protein  28.21 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>