30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1850 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1850  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  253  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0859  hypothetical protein  44.21 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.0660104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4219  hypothetical protein  46.32 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0917932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4285  hypothetical protein  46.32 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10534  hypothetical protein  45.36 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4210  hypothetical protein  42.11 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4276  hypothetical protein  42.11 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4437  hypothetical protein  42.11 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4446  hypothetical protein  43.16 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.925382  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1991  hypothetical protein  43.01 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0930  hypothetical protein  40.2 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0415154  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1500  hypothetical protein  41.96 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.978644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3080  hypothetical protein  37.89 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3123  hypothetical protein  37.89 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3064  hypothetical protein  37.89 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1116  hypothetical protein  40.66 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2803  hypothetical protein  33.64 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1088  hypothetical protein  39.56 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1105  hypothetical protein  39.56 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.656035 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11614  hypothetical protein  39.09 
 
 
136 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.348324  normal  0.226893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3614  hypothetical protein  37.23 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0128407  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1326  hypothetical protein  36.23 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1405  hypothetical protein  33.71 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.909436  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3299  hypothetical protein  33.93 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  hitchhiker  0.00512982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3931  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440778  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3748  hypothetical protein  35.62 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  decreased coverage  0.00385493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1593  hypothetical protein  27.08 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1617  hypothetical protein  27.08 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1563  hypothetical protein  27.08 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11899  hypothetical protein  29.79 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.744585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>