31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3299 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3299  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  277  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  hitchhiker  0.00512982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3931  hypothetical protein  76.61 
 
 
124 aa  190  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440778  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4219  hypothetical protein  44 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0917932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4285  hypothetical protein  44 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4446  hypothetical protein  43 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.925382  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4210  hypothetical protein  42 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4276  hypothetical protein  42 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4437  hypothetical protein  42 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1991  hypothetical protein  38.89 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10534  hypothetical protein  35.96 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0859  hypothetical protein  34 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.0660104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0930  hypothetical protein  43.16 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0415154  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1500  hypothetical protein  35.51 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.978644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1116  hypothetical protein  37.37 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3614  hypothetical protein  38.32 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0128407  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1088  hypothetical protein  36.36 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.429337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1105  hypothetical protein  36.36 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.656035 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3123  hypothetical protein  35.51 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3064  hypothetical protein  35.51 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1405  hypothetical protein  36.78 
 
 
143 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.909436  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3080  hypothetical protein  35.51 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1326  hypothetical protein  46.67 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1850  hypothetical protein  33.93 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2803  hypothetical protein  32.23 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11614  hypothetical protein  40.62 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.348324  normal  0.226893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  34.72 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0980  hypothetical protein  26.8 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1617  hypothetical protein  33.8 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1563  hypothetical protein  33.8 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1593  hypothetical protein  33.8 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0948  hypothetical protein  40.79 
 
 
149 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>