15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0765 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0765  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  230  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2495  hypothetical protein  49.55 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3134  hypothetical protein  51.46 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3391  hypothetical protein  47.57 
 
 
120 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.626556  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4827  hypothetical protein  46.53 
 
 
112 aa  97.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0697192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2595  hypothetical protein  43.36 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3703  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1468  hypothetical protein  32.86 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0453402  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3064  hypothetical protein  39.71 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3123  hypothetical protein  39.71 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3080  hypothetical protein  39.71 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0797  hypothetical protein  39.19 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0812  hypothetical protein  39.19 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655904  normal  0.0763632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0792  hypothetical protein  39.19 
 
 
157 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5239  hypothetical protein  32.46 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80117  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>