19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1468 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1468  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  333  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0453402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0792  hypothetical protein  31.51 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1028  hypothetical protein  39.56 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.59026  normal  0.233634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0797  hypothetical protein  30.82 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0812  hypothetical protein  30.82 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655904  normal  0.0763632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5239  hypothetical protein  37.36 
 
 
158 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80117  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1797  hypothetical protein  34.07 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0587413  normal  0.0252457 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10591  hypothetical protein  34.04 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000170105  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2035  hypothetical protein  29.13 
 
 
180 aa  47.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3703  hypothetical protein  35.29 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0765  hypothetical protein  32.86 
 
 
112 aa  44.3  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4262  hypothetical protein  31.68 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.877042  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1728  hypothetical protein  29.31 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247315  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  27.84 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  31.63 
 
 
142 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  31.63 
 
 
142 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  31.63 
 
 
142 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0172  hypothetical protein  29.67 
 
 
155 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  29.9 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>