12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3703 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3703  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2495  hypothetical protein  42.86 
 
 
113 aa  57.8  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3134  hypothetical protein  40.58 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0765  hypothetical protein  41.67 
 
 
112 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3391  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.626556  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1797  hypothetical protein  40.96 
 
 
157 aa  47.8  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0587413  normal  0.0252457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4827  hypothetical protein  48.72 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0697192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1468  hypothetical protein  35.29 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0453402  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1971  hypothetical protein  30.3 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  33.04 
 
 
157 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1838  hypothetical protein  38.71 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2595  hypothetical protein  38.55 
 
 
115 aa  40.8  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>