43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3685 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  529  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  60.22 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  60.87 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  60.15 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  60.57 
 
 		 261 aa  294  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  57.95 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  60.71 
 
 		 255 aa  291  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  58.43 
 
 		 263 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  58.89 
 
 		 264 aa  279  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  50.81 
 
 		 495 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  50.2 
 
 		 503 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  48.63 
 
 		 506 aa  218  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  47.01 
 
 		 503 aa  215  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  45.53 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  46.18 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  50.62 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  42.02 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  42.97 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  42.29 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  42.41 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  40.77 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  43.24 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  37.93 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  36.48 
 
 		 497 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  34.8 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  29.02 
 
 		 620 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  35.19 
 
 		 245 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  29.18 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  32.44 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  33.47 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  32.63 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  33.47 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  29.58 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  30.61 
 
 		 507 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  32.22 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  29.29 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  27.83 
 
 		 646 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  26.91 
 
 		 508 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  26.46 
 
 		 497 aa  95.5  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  27.27 
 
 		 601 aa  93.6  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  25.82 
 
 		 545 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  29.6 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  28.93 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>