14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3085 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3085  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  593  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0604  hypothetical protein  44.83 
 
 		 263 aa  235  7e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00834327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0662  hypothetical protein  47.77 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05140  N-formylglutamate amidohydrolase  44.73 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  29.17 
 
 		 664 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  29.79 
 
 		 664 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4168  hypothetical protein  29.75 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  30.77 
 
 		 663 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11003  hypothetical protein  28 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0721852  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  22.66 
 
 		 656 aa  80.1  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  28.4 
 
 		 663 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  23.14 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4905  hypothetical protein  42.59 
 
 		 62 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38069  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  23.91 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>