43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0101 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1180    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  40.47 
 
 		 646 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  31.64 
 
 		 503 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  30.17 
 
 		 495 aa  211  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  29.85 
 
 		 506 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  30.55 
 
 		 503 aa  189  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  26.97 
 
 		 620 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  26.31 
 
 		 507 aa  161  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  27.61 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  26.26 
 
 		 497 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  27.11 
 
 		 545 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  30.71 
 
 		 497 aa  134  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  37.07 
 
 		 244 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  35.29 
 
 		 244 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  34.31 
 
 		 242 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  35.95 
 
 		 244 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  25.94 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  35.71 
 
 		 245 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  36 
 
 		 244 aa  124  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  31.52 
 
 		 253 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  33.86 
 
 		 245 aa  118  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  30.63 
 
 		 278 aa  118  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  31.2 
 
 		 261 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  33.99 
 
 		 245 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  34.45 
 
 		 244 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  36.55 
 
 		 244 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  31.13 
 
 		 261 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  34.19 
 
 		 230 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  32.52 
 
 		 243 aa  114  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  35.15 
 
 		 248 aa  113  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  30.28 
 
 		 261 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  30.93 
 
 		 263 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  30.77 
 
 		 262 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  27.95 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  36.08 
 
 		 264 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  28.15 
 
 		 230 aa  97.8  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  30.9 
 
 		 245 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  94.4  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  27.2 
 
 		 269 aa  93.6  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  29.13 
 
 		 246 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  31.11 
 
 		 255 aa  90.9  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  27.62 
 
 		 232 aa  89  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  27.13 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>