15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1648 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1648  50S ribosomal protein L14e  100 
 
 
77 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.481236  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0266  50S ribosomal protein L14e  98.7 
 
 
77 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0980  50S ribosomal protein L14e  97.4 
 
 
77 aa  148  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1498  50S ribosomal protein L14e  88.31 
 
 
77 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1126  50S ribosomal protein L14e  81.82 
 
 
94 aa  130  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1371  50S ribosomal protein L14  58.02 
 
 
96 aa  98.2  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0462  50S ribosomal protein L14e  53.66 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0053  50S ribosomal protein L14e  56.96 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0055  50S ribosomal protein L14e  54.88 
 
 
96 aa  92  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1127  50S ribosomal protein L14e  54.43 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000887763 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0088  50S ribosomal protein L14e  55.7 
 
 
103 aa  90.1  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0079  50S ribosomal protein L14e  56.41 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.149247 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0158  ribosomal protein L14E  51.9 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.574976  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25577  predicted protein  37.5 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0217  hypothetical protein  32.2 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.934654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>