15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0266 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0266  50S ribosomal protein L14e  100 
 
 
77 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0980  50S ribosomal protein L14e  98.7 
 
 
77 aa  150  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1648  50S ribosomal protein L14e  98.7 
 
 
77 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.481236  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1498  50S ribosomal protein L14e  88.31 
 
 
77 aa  140  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1126  50S ribosomal protein L14e  81.82 
 
 
94 aa  131  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1371  50S ribosomal protein L14  56.79 
 
 
96 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0053  50S ribosomal protein L14e  55.7 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0462  50S ribosomal protein L14e  52.44 
 
 
98 aa  90.1  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0055  50S ribosomal protein L14e  53.66 
 
 
96 aa  90.1  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1127  50S ribosomal protein L14e  53.16 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000887763 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0088  50S ribosomal protein L14e  54.43 
 
 
103 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0079  50S ribosomal protein L14e  55.13 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.149247 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0158  ribosomal protein L14E  50.63 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.574976  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25577  predicted protein  35.94 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0217  hypothetical protein  35.59 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.934654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>