16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0329 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0329  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0508  hypothetical protein  94.74 
 
 
190 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1411  hypothetical protein  93.68 
 
 
190 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0574  hypothetical protein  78.42 
 
 
190 aa  326  1.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3230  hypothetical protein  39.29 
 
 
169 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0497  hypothetical protein  39.22 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000155339  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  35.71 
 
 
325 aa  46.2  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  25.33 
 
 
383 aa  45.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1533  hypothetical protein  34.48 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.475102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2942  hypothetical protein  35.29 
 
 
169 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0681  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0586  hypothetical protein  37.5 
 
 
299 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 
823 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3718  hypothetical protein  34 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431162 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  23.64 
 
 
433 aa  41.2  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08990  hypothetical protein  30.88 
 
 
142 aa  41.2  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.910252  normal  0.577713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>