13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2468 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2468    100 
 
 
1158 bp  2296    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  100 
 
 
1200 bp  63.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  100 
 
 
1200 bp  63.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3047    100 
 
 
1184 bp  56  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  100 
 
 
1200 bp  56  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  100 
 
 
1200 bp  56  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  96.77 
 
 
927 bp  54  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  96.77 
 
 
927 bp  54  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2128  transposase, mutator type  100 
 
 
468 bp  52  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.449064  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2280    100 
 
 
694 bp  52  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  96.55 
 
 
1212 bp  50.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1065    100 
 
 
1039 bp  50.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  93.75 
 
 
1197 bp  48.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>