18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1755 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1755  cellulose biosynthesis protein CelD  100 
 
 
359 aa  729    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189987  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  38.59 
 
 
359 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7654  cellulose biosynthesis protein CelD  31.97 
 
 
376 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  30.85 
 
 
372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3602  polysaccharide biosynthesis protein CelD  30.96 
 
 
363 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3587  hypothetical protein  29.28 
 
 
363 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  28.78 
 
 
364 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  33.13 
 
 
349 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  28.57 
 
 
360 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1930  polysaccharide biosynthesis protein CelD  30.93 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0135323  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  28.62 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2354  hypothetical protein  28.14 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1351  hypothetical protein  27.49 
 
 
376 aa  126  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6855  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  28.39 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8156  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  26.44 
 
 
468 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0664  cellulose biosynthesis protein CelD  25 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2707  hypothetical protein  29.7 
 
 
380 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.710813  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1858  hypothetical protein  32.88 
 
 
318 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293436  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>