18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0297 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0297  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  140  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.851712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3043  hypothetical protein  39.19 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00029722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04024  hypothetical protein  45 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0883  putative transmembrane protein  40.3 
 
 
73 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1250  putative transmembrane protein  40.3 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342976  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0315  hypothetical protein  46.67 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.172325 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3531  putative transmembrane protein  43.66 
 
 
77 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185259  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2854  putative transmembrane protein  43.48 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.23375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1466  hypothetical protein  42.86 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.478313  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0188  putative transmembrane protein  40.98 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0451  hypothetical protein  32.35 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3006  hypothetical protein  50.82 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.761715  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1680  putative transmembrane protein  39.73 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0475  hypothetical protein  32.35 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1640  hypothetical protein  37.29 
 
 
70 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0343284  normal  0.981714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4386  putative transmembrane protein  37.14 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0254  hypothetical protein  39.66 
 
 
59 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0224  putative transmembrane protein  40 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.508917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>