16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1536 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1536  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1175    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0469049  hitchhiker  0.00325028 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0095  hypothetical protein  30.15 
 
 
453 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00145664 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  32.61 
 
 
456 aa  77  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  32.61 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  29.76 
 
 
486 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  39 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1110  hypothetical protein  30.5 
 
 
445 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1806  hypothetical protein  32.12 
 
 
452 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  30.07 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  36.59 
 
 
549 aa  51.2  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  39.76 
 
 
414 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  38.54 
 
 
450 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0136  hypothetical protein  28.82 
 
 
352 aa  48.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0102155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2222  hypothetical protein  34.62 
 
 
367 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2479  hypothetical protein  28.7 
 
 
319 aa  48.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  32.35 
 
 
421 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>