49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1052 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1052  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.482947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3428  cytochrome c-type biogenesis protein ccdA  73.18 
 
 		 222 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0739386  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.27 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.18 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.52 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  31.28 
 
 		 396 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.1 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.09 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.27 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  30.7 
 
 		 735 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.47 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.47 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0632  cytochrome c-type biogenesis protein  30.22 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.44 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.77 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.82 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.78 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  29.36 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  26.74 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.24 
 
 		 810 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.55 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.55 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.96 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  28.39 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.23 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.4 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.89 
 
 		 244 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.21 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1670  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  26.95 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1604  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.02 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  26.95 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2128  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.12 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  27.94 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5557  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.01 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1111  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.81 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000199763  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.47 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.12 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.45 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1277  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.09 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2062  cytochrome c biogenesis protein  25.35 
 
 		 325 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.76 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2809  cytochrome c biogenesis protein  25.22 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  27.98 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  25.11 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.61 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.19 
 
 		 789 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  24.35 
 
 		 218 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.53 
 
 		 235 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.965188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>