22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0435 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0435  hypothetical protein  100 
 
 
767 aa  1536    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1193  Protein of unknown function DUF460  37.63 
 
 
669 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2320  hypothetical protein  39.94 
 
 
663 aa  434  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2604  hypothetical protein  38.5 
 
 
646 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0481  hypothetical protein  39.39 
 
 
650 aa  413  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.93354  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0547  hypothetical protein  33.28 
 
 
654 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0419873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3698  hypothetical protein  31.92 
 
 
662 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1871  Protein of unknown function DUF460  28.88 
 
 
657 aa  247  6e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2183  Protein of unknown function DUF460  28.99 
 
 
658 aa  244  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0054  Protein of unknown function DUF460  27.84 
 
 
658 aa  243  7.999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0706  Protein of unknown function DUF460  27.71 
 
 
658 aa  231  5e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474274  normal  0.739297 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2504  Protein of unknown function DUF460  29.43 
 
 
697 aa  180  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.459934 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0738  hypothetical protein  29.18 
 
 
662 aa  144  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.00000149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0690  hypothetical protein  28.66 
 
 
591 aa  134  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.120921 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2334  hypothetical protein  28.14 
 
 
585 aa  134  9e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0927872  hitchhiker  0.00309238 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0232  hypothetical protein  25.89 
 
 
602 aa  131  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1179  Protein of unknown function DUF460  28.15 
 
 
613 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.237227  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2104  hypothetical protein  27.4 
 
 
583 aa  105  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1976  hypothetical protein  29.69 
 
 
584 aa  105  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0863  hypothetical protein  25.05 
 
 
639 aa  97.8  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.949823  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.33 
 
 
2449 aa  45.4  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1424  adhesin  29.87 
 
 
2061 aa  45.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.872326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>