20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0232 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0232  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1200    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0116565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1179  Protein of unknown function DUF460  47.37 
 
 		 613 aa  572  1e-161  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.237227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0738  hypothetical protein  35.25 
 
 		 662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.00000149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0547  hypothetical protein  31.09 
 
 		 654 aa  205  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0419873  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0863  hypothetical protein  30.23 
 
 		 639 aa  203  7e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.949823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3698  hypothetical protein  31.6 
 
 		 662 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0054  Protein of unknown function DUF460  34.08 
 
 		 658 aa  191  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2334  hypothetical protein  29.82 
 
 		 585 aa  190  8e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0927872  hitchhiker  0.00309238 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0690  hypothetical protein  29.42 
 
 		 591 aa  183  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.120921 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0481  hypothetical protein  34.26 
 
 		 650 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.93354  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1871  Protein of unknown function DUF460  32.81 
 
 		 657 aa  181  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2604  hypothetical protein  29.54 
 
 		 646 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2104  hypothetical protein  31.88 
 
 		 583 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1976  hypothetical protein  29.79 
 
 		 584 aa  163  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1193  Protein of unknown function DUF460  29.87 
 
 		 669 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2320  hypothetical protein  31.72 
 
 		 663 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0706  Protein of unknown function DUF460  32.42 
 
 		 658 aa  147  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474274  normal  0.739297 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2183  Protein of unknown function DUF460  31.59 
 
 		 658 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2504  Protein of unknown function DUF460  31.76 
 
 		 697 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.459934 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0435  hypothetical protein  25.89 
 
 		 767 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>