21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2104 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0690  hypothetical protein  66.32 
 
 
591 aa  811    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.120921 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1976  hypothetical protein  67.81 
 
 
584 aa  793    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2104  hypothetical protein  100 
 
 
583 aa  1168    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2334  hypothetical protein  67.69 
 
 
585 aa  823    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0927872  hitchhiker  0.00309238 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0863  hypothetical protein  36.01 
 
 
639 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.949823  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0738  hypothetical protein  38.46 
 
 
662 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.00000149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0547  hypothetical protein  31.45 
 
 
654 aa  212  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0419873  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1179  Protein of unknown function DUF460  26.69 
 
 
613 aa  195  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.237227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0232  hypothetical protein  31.67 
 
 
602 aa  192  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3698  hypothetical protein  29.64 
 
 
662 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2320  hypothetical protein  31.06 
 
 
663 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2604  hypothetical protein  30.02 
 
 
646 aa  160  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0481  hypothetical protein  31.58 
 
 
650 aa  156  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.93354  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1193  Protein of unknown function DUF460  33.33 
 
 
669 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0706  Protein of unknown function DUF460  33.51 
 
 
658 aa  150  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474274  normal  0.739297 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0054  Protein of unknown function DUF460  29.62 
 
 
658 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1871  Protein of unknown function DUF460  29.26 
 
 
657 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2183  Protein of unknown function DUF460  31.38 
 
 
658 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0435  hypothetical protein  27.23 
 
 
767 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2504  Protein of unknown function DUF460  30.98 
 
 
697 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.459934 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04670  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 
2094 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>