16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4644 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4556  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  460  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4644  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  460  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4939  hypothetical protein  99.15 
 
 
234 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5133  hypothetical protein  74.79 
 
 
236 aa  355  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1620  hypothetical protein  74.79 
 
 
234 aa  351  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10799  hypothetical protein  66.67 
 
 
228 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3616  hypothetical protein  54.95 
 
 
232 aa  241  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.689056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6882  deacetylase-like protein  38.94 
 
 
219 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  29.18 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  31.33 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17920  hypothetical protein  32.08 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00986232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  31.65 
 
 
253 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  32.17 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  31.69 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  31.47 
 
 
254 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1009  putative deacetylase  29.37 
 
 
254 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00774779  hitchhiker  0.00000000000895825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>