53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4585 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 147 aa  300  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 147 aa  300  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  99.32 
 
 		 147 aa  298  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  61.64 
 
 		 146 aa  190  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  65.73 
 
 		 146 aa  189  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  58.33 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  54.68 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  55.65 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  51.43 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  48.23 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  48.94 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  48.94 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  48.94 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  46.1 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  46.1 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  46.1 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  46.1 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  43.26 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  47.52 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  47.52 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  47.52 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  35 
 
 		 146 aa  95.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  35.14 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  34.03 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  33.8 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  29.58 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  32.41 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  31.69 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  29.93 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  28.17 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  32.19 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  35.17 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  32.41 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  32.39 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  31.47 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  26.39 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  27.21 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  26.62 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  27.86 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  27.86 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  27.86 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  28.87 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  25.87 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>