58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3342 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  99.31 
 
 		 145 aa  282  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  86.21 
 
 		 145 aa  255  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  84.83 
 
 		 145 aa  251  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  69.44 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  53.47 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  51.03 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  53.79 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  48.97 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  46.53 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  48.97 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  48.61 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  48.28 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  47.95 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  45.52 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  43.75 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  43.06 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  44.14 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  46.21 
 
 		 146 aa  120  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  43.84 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  40.56 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  42.47 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  39.01 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  36.09 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  33.57 
 
 		 160 aa  86.7  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  36.17 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  32.39 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  28.97 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  26.06 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  27.56 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  24.64 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  32.43 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  31.53 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  30.63 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  23.74 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  23.74 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  23.74 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  30.34 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  24.58 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0022  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 		 155 aa  40  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>