18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0056 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0052  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.290832  normal  0.159896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0016  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0020  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0019  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.307428  hitchhiker  0.00000285444 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0028  tRNA-Leu  84.13 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.491326  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>