38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3014 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3014  RNA-binding protein  100 
 
 		 82 aa  166  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1974  hypothetical protein  52.7 
 
 		 86 aa  90.9  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0534  protein of unknown function UPF0044  55.71 
 
 		 80 aa  87.8  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000506447  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1888  hypothetical protein  56.72 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.456181 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0090  protein of unknown function UPF0044  34.67 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3199  protein of unknown function UPF0044  33.33 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1362  hypothetical protein  38.03 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1419  hypothetical protein  35.71 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1188  protein of unknown function UPF0044  36.11 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00596484  hitchhiker  0.000000832175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2315  protein of unknown function UPF0044  37.68 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2457  protein of unknown function UPF0044  36.23 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000030989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1894  protein of unknown function UPF0044  37.68 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4184  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0603657  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1999  protein of unknown function UPF0044  34.72 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0289253 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4560  hypothetical protein  31.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0173366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1637  hypothetical protein  30.43 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4414  hypothetical protein  31.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1188  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0994  protein of unknown function UPF0044  33.33 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4466  conserved hypothetical protein TIGR00253  31.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000735494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4453  conserved hypothetical protein TIGR00253  31.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0784  hypothetical protein TIGR00253  31.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000244145  hitchhiker  0.00000644143 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4355  conserved hypothetical protein TIGR00253  31.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0557259 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4079  hypothetical protein  31.88 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.289994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4231  hypothetical protein  31.88 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4069  hypothetical protein  31.88 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000290604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1324  protein of unknown function UPF0044  30.43 
 
 		 96 aa  43.9  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.404725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1263  hypothetical protein  34.62 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2232  protein of unknown function UPF0044  30.77 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000120736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0481  hypothetical protein  41.03 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0235201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3059  hypothetical protein  30.43 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0746318  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1663  hypothetical protein  39.22 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.593227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3700  hypothetical protein  27.94 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1160  hypothetical protein  45.65 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2713  hypothetical protein  31.88 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2844  hypothetical protein  31.88 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1162  hypothetical protein  30.43 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.892315  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1584  RNA-binding protein  39.22 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00164206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>