20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1592 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1592  nuclear transport factor 2  100 
 
 
144 aa  294  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5165  nuclear transport factor 2  89.58 
 
 
143 aa  268  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4969  nuclear transport factor 2  82.27 
 
 
143 aa  245  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4586  nuclear transport factor 2  81.56 
 
 
143 aa  244  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4674  nuclear transport factor 2  81.56 
 
 
143 aa  244  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10775  hypothetical protein  66.67 
 
 
139 aa  208  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  38.89 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2441  hypothetical protein  36.29 
 
 
133 aa  84.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.655393  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  33.33 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3969  hypothetical protein  34.88 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  36.45 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12079  hypothetical protein  29.77 
 
 
265 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3185  nuclear transport factor 2  31.86 
 
 
268 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572325  normal  0.409809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3431  nuclear transport factor 2  48 
 
 
267 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2918  nuclear transport factor 2  27.27 
 
 
274 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2932  nuclear transport factor 2  27.27 
 
 
274 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  19.81 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2888  nuclear transport factor 2  27.27 
 
 
274 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0754079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  29.51 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3596  nuclear transport factor 2  29.46 
 
 
128 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>