32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2731 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  76.55 
 
 		 512 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  76.29 
 
 		 513 aa  736    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  75.64 
 
 		 528 aa  729    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  93.1 
 
 		 508 aa  927    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  97.83 
 
 		 508 aa  960    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  77.04 
 
 		 516 aa  742    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  84.65 
 
 		 509 aa  835    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  100 
 
 		 508 aa  1017    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  72.65 
 
 		 534 aa  732    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  73.78 
 
 		 500 aa  680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  74.21 
 
 		 502 aa  684    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2979  chlorophyllide reductase subunit Y  76.77 
 
 		 468 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.927182  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  74.63 
 
 		 502 aa  688    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  76.27 
 
 		 533 aa  728    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  74.42 
 
 		 521 aa  720    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  75.37 
 
 		 535 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  75.64 
 
 		 540 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1609  chlorophyllide reductase subunit Y  72.98 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  39.56 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  40.72 
 
 		 438 aa  276  8e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  36.23 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  36.89 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  36.41 
 
 		 412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  36.98 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  39.08 
 
 		 422 aa  266  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  36.93 
 
 		 418 aa  266  8e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  35.68 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  34.38 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.37 
 
 		 468 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0747  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.32 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.957633  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.56 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3718  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  30.35 
 
 		 420 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.834431  normal  0.0122696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>