31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1830 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2165  protein of unknown function DUF201  94.12 
 
 		 412 aa  661    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.292956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1830  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  733    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1781  protein of unknown function DUF201  84.76 
 
 		 378 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  59.77 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  59.54 
 
 		 383 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5779  hypothetical protein  52.77 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0168364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  39.83 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  39.53 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  33.91 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  34.97 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  37.05 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  30.38 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2862  hypothetical protein  31.55 
 
 		 380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  33.92 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  31.62 
 
 		 402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  31 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  30.91 
 
 		 415 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  24 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  22.22 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  26.52 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  26.58 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  23.46 
 
 		 302 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  23.02 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  20.99 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  18.79 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4917  D-alanine/D-alanine ligase  29.66 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.912808  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  29.46 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1592  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.74 
 
 		 619 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.430094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  27.17 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.05 
 
 		 1065 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  22.34 
 
 		 357 aa  42.7  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>