18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1368 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3740  cellulose synthase subunit B  67.3 
 
 		 842 aa  1027    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1568  cellulose synthase subunit B  96.03 
 
 		 880 aa  1499    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1313  hypothetical protein  86.57 
 
 		 875 aa  1382    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1368  hypothetical protein  100 
 
 		 881 aa  1704    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0776152  normal  0.0920339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0274  hypothetical protein  64.35 
 
 		 862 aa  999    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4804  cellulose synthase subunit B  40.72 
 
 		 843 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.328692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0106  hypothetical protein  43.63 
 
 		 858 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00890818  normal  0.867993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  37.19 
 
 		 766 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1205  cellulose synthase subunit B  28.34 
 
 		 817 aa  237  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1294  cellulose synthase subunit B  27.32 
 
 		 813 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5209  cellulose synthase subunit B  30.12 
 
 		 773 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5534  celB protein  29.33 
 
 		 758 aa  174  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0963  hypothetical protein  28.92 
 
 		 721 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355917 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  22.61 
 
 		 758 aa  95.1  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0332  cellulose synthase  26.34 
 
 		 725 aa  90.1  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1977  putative cellulose synthase  25.57 
 
 		 725 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.94511  normal  0.202937 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4174  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 727 aa  73.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0572  hypothetical protein  23.31 
 
 		 768 aa  45.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>