40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0804 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0804  phage uncharacterized protein  100 
 
 
485 aa  986    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0801  Phage uncharacterized protein-like  41.65 
 
 
466 aa  350  4e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814229  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1184  Phage uncharacterized protein-like  43.24 
 
 
493 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0814  phage uncharacterized protein  42.27 
 
 
451 aa  325  9e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.93566  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0377  Phage uncharacterized protein, C-terminal  34.08 
 
 
469 aa  299  9e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0430074  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0665  phage uncharacterized protein  33.41 
 
 
469 aa  292  9e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.410967  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1016  phage uncharacterized protein  35.39 
 
 
487 aa  287  2.9999999999999996e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0660227  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0967  phage uncharacterized protein  33.78 
 
 
465 aa  283  6.000000000000001e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.451476  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0224  phage uncharacterized protein  34.47 
 
 
488 aa  199  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6558  phage uncharacterized protein  34.07 
 
 
494 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0181003  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0302  chaperone and heat shock protein 70  32.72 
 
 
484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.763978  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5956  phage uncharacterized protein  34.53 
 
 
456 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6997  phage uncharacterized protein  32.96 
 
 
491 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00823  phage uncharacterized protein  33.76 
 
 
913 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3004  Phage uncharacterized protein-like  31.04 
 
 
484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3556  phage uncharacterized protein  31.04 
 
 
490 aa  163  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2507  phage uncharacterized protein  33.95 
 
 
461 aa  160  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  33.88 
 
 
492 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1212  phage uncharacterized protein  31.58 
 
 
461 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1132  phage uncharacterized protein  33.33 
 
 
295 aa  151  3e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2266  phage uncharacterized protein  29.12 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  hitchhiker  0.000265113 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1048  phage uncharacterized protein  30.43 
 
 
516 aa  139  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0343018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1307  hypothetical protein  30.65 
 
 
505 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2388  Phage uncharacterized protein, C-terminal  28.37 
 
 
516 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3888  hypothetical protein  28.51 
 
 
496 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2841  phage uncharacterized protein  27.48 
 
 
522 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0542  phage uncharacterized protein  28.95 
 
 
495 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0957  hypothetical protein  25.79 
 
 
469 aa  106  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000035245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2971  phage uncharacterized protein  27.54 
 
 
471 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566007  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2225  phage uncharacterized protein  26.67 
 
 
547 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0340068  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1778  hypothetical protein  25.23 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1133  Phage terminase, large subunit  24.94 
 
 
462 aa  84.7  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.151722  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0014  hypothetical protein  23.76 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2305  phage uncharacterized protein, putative  25.96 
 
 
491 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1106  phage uncharacterized protein-like protein  26.46 
 
 
601 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139903 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2556  Phage uncharacterized protein-like  25.15 
 
 
505 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5343  phage uncharacterized protein  21.84 
 
 
586 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0266  hypothetical protein  22.66 
 
 
500 aa  50.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0639  hypothetical protein  24.05 
 
 
519 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0679794  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0249  phage uncharacterized protein  22.41 
 
 
527 aa  43.1  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>