30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0308 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0308  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  140  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0384  hypothetical protein  88 
 
 		 75 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.953728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0352  hypothetical protein  98.21 
 
 		 56 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.506567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5487  hypothetical protein  66.13 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3760  hypothetical protein  56.94 
 
 		 73 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0432605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0217  hypothetical protein  60.78 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.357696 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0967  hypothetical protein  55.88 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.997665  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2676  hypothetical protein  59.21 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1778  hypothetical protein  63.64 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.307471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4466  hypothetical protein  61.29 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7107  hypothetical protein  56.06 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75876  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2029  hypothetical protein  52.24 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.479458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0858  hypothetical protein  59.72 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0291  hypothetical protein  51.61 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3210  hypothetical protein  53.73 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5375  hypothetical protein  59.26 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00434628  normal  0.527064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0273  hypothetical protein  55 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0307  hypothetical protein  52.54 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7941  hypothetical protein  52.83 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2684  hypothetical protein  87.88 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4454  hypothetical protein  64.71 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3774  hypothetical protein  53.7 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0026  hypothetical protein  50.85 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0044  hypothetical protein  60.47 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3617  hypothetical protein  58.82 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3908  hypothetical protein  71.43 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4295  hypothetical protein  56.86 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0883  hypothetical protein  67.86 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.755971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0922  hypothetical protein  66.67 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.02589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5197  hypothetical protein  75.56 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>