43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0224 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0224  phage uncharacterized protein  100 
 
 
488 aa  998    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00823  phage uncharacterized protein  42.82 
 
 
913 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2507  phage uncharacterized protein  35.12 
 
 
461 aa  210  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0804  phage uncharacterized protein  34.47 
 
 
485 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0302  chaperone and heat shock protein 70  32.47 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.763978  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1184  Phage uncharacterized protein-like  29.2 
 
 
493 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0814  phage uncharacterized protein  31.07 
 
 
451 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.93566  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0665  phage uncharacterized protein  25.17 
 
 
469 aa  172  9e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.410967  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0542  phage uncharacterized protein  31.45 
 
 
495 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0377  Phage uncharacterized protein, C-terminal  25.62 
 
 
469 aa  171  3e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0430074  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0801  Phage uncharacterized protein-like  29.63 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814229  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3888  hypothetical protein  33.23 
 
 
496 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1016  phage uncharacterized protein  26.64 
 
 
487 aa  155  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0660227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6558  phage uncharacterized protein  29.32 
 
 
494 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0181003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2841  phage uncharacterized protein  28.51 
 
 
522 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0967  phage uncharacterized protein  25.11 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.451476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5956  phage uncharacterized protein  29.59 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0957  hypothetical protein  27.07 
 
 
469 aa  133  6e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000035245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2971  phage uncharacterized protein  29.08 
 
 
471 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6997  phage uncharacterized protein  28.48 
 
 
491 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1212  phage uncharacterized protein  28.54 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3556  phage uncharacterized protein  27 
 
 
490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0014  hypothetical protein  27.49 
 
 
484 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2266  phage uncharacterized protein  27.05 
 
 
512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  hitchhiker  0.000265113 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1048  phage uncharacterized protein  29.72 
 
 
516 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0343018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1307  hypothetical protein  29.72 
 
 
505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2388  Phage uncharacterized protein, C-terminal  26.6 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  31.51 
 
 
492 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1133  Phage terminase, large subunit  27.85 
 
 
462 aa  96.7  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.151722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3004  Phage uncharacterized protein-like  24.73 
 
 
484 aa  96.7  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1778  hypothetical protein  27.07 
 
 
462 aa  95.1  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2556  Phage uncharacterized protein-like  23.12 
 
 
505 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2225  phage uncharacterized protein  21.8 
 
 
547 aa  67  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0340068  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0249  phage uncharacterized protein  23.22 
 
 
527 aa  63.2  0.000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0639  hypothetical protein  23.38 
 
 
519 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0679794  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1132  phage uncharacterized protein  24.27 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2384  phage protein  20.34 
 
 
571 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2305  phage uncharacterized protein, putative  21.75 
 
 
491 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0755  hypothetical protein  23.03 
 
 
546 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.891172  normal  0.995828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0432  phage uncharacterized protein  22.58 
 
 
537 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0728  phage uncharacterized protein  22.42 
 
 
558 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4252  hypothetical protein  28.89 
 
 
554 aa  44.3  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0266  hypothetical protein  23.75 
 
 
500 aa  43.9  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>