43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0745 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  47.84 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  42.79 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  44.54 
 
 
230 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  36.89 
 
 
495 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  38.89 
 
 
506 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  38.16 
 
 
245 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  35.32 
 
 
245 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  35.47 
 
 
244 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  33.47 
 
 
244 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  38.96 
 
 
503 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  34.75 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  35.15 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  35.22 
 
 
507 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  36.56 
 
 
245 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  40.17 
 
 
248 aa  138  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  38.6 
 
 
481 aa  137  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  34.78 
 
 
253 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  36.56 
 
 
244 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  36.84 
 
 
497 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  35.42 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  38.02 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  34.98 
 
 
508 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  32.74 
 
 
243 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  39.91 
 
 
503 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  33.47 
 
 
269 aa  118  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  34.36 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  35.84 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  30.88 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  32.22 
 
 
255 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  31.67 
 
 
261 aa  115  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  33.48 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  35.16 
 
 
497 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  32.44 
 
 
262 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  33.33 
 
 
242 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  35.22 
 
 
264 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  32.5 
 
 
646 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  33.04 
 
 
245 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  34.51 
 
 
288 aa  99  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  35.71 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  35.71 
 
 
545 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  29.83 
 
 
601 aa  92.8  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  32.47 
 
 
620 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>