18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4804 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4804  cellulose synthase subunit B  100 
 
 		 843 aa  1639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.328692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0106  hypothetical protein  56.2 
 
 		 858 aa  798    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00890818  normal  0.867993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3740  cellulose synthase subunit B  44.47 
 
 		 842 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1313  hypothetical protein  40.74 
 
 		 875 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0274  hypothetical protein  41.51 
 
 		 862 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1368  hypothetical protein  41.07 
 
 		 881 aa  515  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0776152  normal  0.0920339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1568  cellulose synthase subunit B  41.39 
 
 		 880 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  37.2 
 
 		 766 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1205  cellulose synthase subunit B  32.64 
 
 		 817 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1294  cellulose synthase subunit B  32.02 
 
 		 813 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5534  celB protein  29.73 
 
 		 758 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5209  cellulose synthase subunit B  30.75 
 
 		 773 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0963  hypothetical protein  27.02 
 
 		 721 aa  82  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0332  cellulose synthase  23.25 
 
 		 725 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1977  putative cellulose synthase  23.08 
 
 		 725 aa  75.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.94511  normal  0.202937 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4174  putative PAS/PAC sensor protein  26.35 
 
 		 727 aa  73.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  24.12 
 
 		 758 aa  60.1  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0572  hypothetical protein  25.62 
 
 		 768 aa  50.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>